MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 8251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018416	ATGA	2	8	1	8	50 %	25 %	25 %	0 %	400404264
2	NC_018416	TAT	2	6	9	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
3	NC_018416	CAG	2	6	29	34	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404264
4	NC_018416	A	6	6	72	77	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
5	NC_018416	TAA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
6	NC_018416	A	10	10	105	114	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
7	NC_018416	A	7	7	117	123	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
8	NC_018416	A	6	6	125	130	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
9	NC_018416	AT	3	6	133	138	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
10	NC_018416	A	6	6	173	178	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
11	NC_018416	T	8	8	188	195	0 %	100 %	0 %	0 %	400404264
12	NC_018416	ATT	2	6	251	256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
13	NC_018416	TAAA	2	8	263	270	75 %	25 %	0 %	0 %	400404264
14	NC_018416	TTAA	2	8	271	278	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
15	NC_018416	T	7	7	287	293	0 %	100 %	0 %	0 %	400404264
16	NC_018416	AGAA	2	8	327	334	75 %	0 %	25 %	0 %	400404264
17	NC_018416	ATT	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
18	NC_018416	ATT	2	6	373	378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
19	NC_018416	TA	3	6	392	397	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
20	NC_018416	A	7	7	434	440	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
21	NC_018416	ATTTAA	2	12	471	482	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
22	NC_018416	TAT	3	9	483	491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
23	NC_018416	TAA	2	6	519	524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
24	NC_018416	A	7	7	534	540	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
25	NC_018416	ATTTT	2	10	542	551	20 %	80 %	0 %	0 %	400404264
26	NC_018416	T	7	7	561	567	0 %	100 %	0 %	0 %	400404264
27	NC_018416	A	7	7	568	574	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
28	NC_018416	A	7	7	576	582	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
29	NC_018416	TTAA	2	8	583	590	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
30	NC_018416	A	6	6	611	616	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
31	NC_018416	ATT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
32	NC_018416	A	6	6	627	632	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
33	NC_018416	ATA	2	6	649	654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
34	NC_018416	AGA	2	6	658	663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404264
35	NC_018416	TTTA	2	8	681	688	25 %	75 %	0 %	0 %	400404264
36	NC_018416	AAC	2	6	735	740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404264
37	NC_018416	A	6	6	741	746	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
38	NC_018416	ATAA	2	8	751	758	75 %	25 %	0 %	0 %	400404264
39	NC_018416	T	9	9	764	772	0 %	100 %	0 %	0 %	400404264
40	NC_018416	A	7	7	778	784	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
41	NC_018416	CAG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404264
42	NC_018416	A	6	6	836	841	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
43	NC_018416	A	6	6	852	857	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
44	NC_018416	TAA	2	6	861	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
45	NC_018416	AGT	2	6	877	882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404264
46	NC_018416	TA	4	8	890	897	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
47	NC_018416	A	8	8	915	922	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
48	NC_018416	TTTA	2	8	924	931	25 %	75 %	0 %	0 %	400404264
49	NC_018416	AT	4	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
50	NC_018416	A	6	6	953	958	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
51	NC_018416	AAAAT	2	10	965	974	80 %	20 %	0 %	0 %	400404264
52	NC_018416	TAT	2	6	975	980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
53	NC_018416	TAAT	2	8	983	990	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
54	NC_018416	AAG	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404264
55	NC_018416	TAAAT	2	10	1026	1035	60 %	40 %	0 %	0 %	400404264
56	NC_018416	ATT	4	12	1039	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
57	NC_018416	A	6	6	1062	1067	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
58	NC_018416	TAA	2	6	1068	1073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
59	NC_018416	TAAT	2	8	1076	1083	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
60	NC_018416	AAAAT	2	10	1084	1093	80 %	20 %	0 %	0 %	400404264
61	NC_018416	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
62	NC_018416	A	6	6	1121	1126	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
63	NC_018416	TAAT	2	8	1130	1137	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
64	NC_018416	ATT	3	9	1164	1172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
65	NC_018416	T	6	6	1187	1192	0 %	100 %	0 %	0 %	400404264
66	NC_018416	T	8	8	1200	1207	0 %	100 %	0 %	0 %	400404264
67	NC_018416	ATT	2	6	1219	1224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
68	NC_018416	ATA	2	6	1234	1239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
69	NC_018416	A	9	9	1247	1255	100 %	0 %	0 %	0 %	400404264
70	NC_018416	TA	3	6	1256	1261	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
71	NC_018416	T	6	6	1299	1304	0 %	100 %	0 %	0 %	400404264
72	NC_018416	AAT	2	6	1328	1333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
73	NC_018416	ATT	2	6	1344	1349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
74	NC_018416	ATA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
75	NC_018416	TAA	2	6	1406	1411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
76	NC_018416	TGG	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400404265
77	NC_018416	TAA	2	6	1495	1500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
78	NC_018416	GGT	2	6	1518	1523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400404265
79	NC_018416	ATT	2	6	1543	1548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
80	NC_018416	ATTC	2	8	1554	1561	25 %	50 %	0 %	25 %	400404265
81	NC_018416	A	6	6	1578	1583	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
82	NC_018416	ATTC	2	8	1593	1600	25 %	50 %	0 %	25 %	400404265
83	NC_018416	TA	3	6	1627	1632	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
84	NC_018416	ATT	2	6	1652	1657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
85	NC_018416	A	9	9	1661	1669	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
86	NC_018416	TAA	2	6	1672	1677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
87	NC_018416	A	8	8	1694	1701	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
88	NC_018416	A	10	10	1713	1722	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
89	NC_018416	A	6	6	1814	1819	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
90	NC_018416	TAAA	2	8	1831	1838	75 %	25 %	0 %	0 %	400404265
91	NC_018416	TAAA	2	8	1840	1847	75 %	25 %	0 %	0 %	400404265
92	NC_018416	A	7	7	1845	1851	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
93	NC_018416	A	7	7	1875	1881	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
94	NC_018416	ATT	2	6	1886	1891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
95	NC_018416	TAA	2	6	1895	1900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
96	NC_018416	CCT	2	6	1917	1922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400404265
97	NC_018416	ATTA	2	8	1941	1948	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
98	NC_018416	A	7	7	1950	1956	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
99	NC_018416	ATT	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
100	NC_018416	T	7	7	1985	1991	0 %	100 %	0 %	0 %	400404265
101	NC_018416	ATTTTA	2	12	1999	2010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
102	NC_018416	ATA	3	9	2011	2019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
103	NC_018416	TTA	2	6	2029	2034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
104	NC_018416	A	11	11	2066	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
105	NC_018416	ATC	3	9	2081	2089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404265
106	NC_018416	TA	3	6	2090	2095	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
107	NC_018416	ATC	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404265
108	NC_018416	AGA	2	6	2141	2146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404265
109	NC_018416	ATC	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404265
110	NC_018416	T	7	7	2185	2191	0 %	100 %	0 %	0 %	400404265
111	NC_018416	AT	3	6	2220	2225	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
112	NC_018416	CTT	2	6	2242	2247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404265
113	NC_018416	A	6	6	2255	2260	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
114	NC_018416	A	9	9	2263	2271	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
115	NC_018416	TTA	2	6	2272	2277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
116	NC_018416	A	7	7	2277	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
117	NC_018416	ATT	2	6	2338	2343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
118	NC_018416	TAA	2	6	2387	2392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
119	NC_018416	T	9	9	2395	2403	0 %	100 %	0 %	0 %	400404265
120	NC_018416	AAC	2	6	2420	2425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404265
121	NC_018416	GAG	2	6	2433	2438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400404265
122	NC_018416	GCA	2	6	2439	2444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404265
123	NC_018416	TGC	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400404265
124	NC_018416	ATT	3	9	2492	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
125	NC_018416	A	6	6	2511	2516	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
126	NC_018416	TA	3	6	2526	2531	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
127	NC_018416	TAAT	2	8	2539	2546	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
128	NC_018416	ATT	2	6	2609	2614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
129	NC_018416	AT	3	6	2634	2639	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
130	NC_018416	TA	3	6	2644	2649	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
131	NC_018416	TTA	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
132	NC_018416	CTT	2	6	2671	2676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404265
133	NC_018416	TAA	2	6	2696	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
134	NC_018416	TA	3	6	2703	2708	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
135	NC_018416	AT	3	6	2709	2714	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
136	NC_018416	ATTTT	2	10	2727	2736	20 %	80 %	0 %	0 %	400404265
137	NC_018416	T	8	8	2733	2740	0 %	100 %	0 %	0 %	400404265
138	NC_018416	A	12	12	2741	2752	100 %	0 %	0 %	0 %	400404265
139	NC_018416	T	8	8	2755	2762	0 %	100 %	0 %	0 %	400404265
140	NC_018416	ATA	3	9	2775	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
141	NC_018416	AT	3	6	2801	2806	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
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143	NC_018416	ATTT	2	8	2840	2847	25 %	75 %	0 %	0 %	400404266
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